panalungtikanbg

Genetika populasi-lega génom sarta ngawas molekular résistansi inséktisida dina reungit Anopheles di Sebatkilo, Awash, Étiopia

Saprak kapanggihna di Djibouti taun 2012, reungit Asian Anopheles stephensi geus sumebar ka sakuliah Tanduk Afrika. Vektor invasif ieu terus sumebar ka sakuliah buana, nyababkeun ancaman serius pikeun program kontrol malaria. Métode kontrol vektor, kalebet jaring ranjang anu diolah ku inséktisida sareng nyemprot sésa-sésa jero ruangan, parantos ngirangan beban malaria sacara signifikan. Tapi, ngaronjatna Prévalénsi reungit tahan inséktisida, kaasup populasi Anopheles stephensi, ngahambat usaha ngaleungitkeun malaria. Ngartos struktur populasi, aliran gen antara populasi, sareng distribusi mutasi résistansi inséktisida penting pisan pikeun panduan strategi kontrol malaria anu efektif.
Ngaronjatkeun pamahaman urang kumaha An. Stephensi janten mapan di HOA penting pisan pikeun ngaramalkeun poténsi panyebaranna ka daérah énggal. Genetika populasi geus dipaké sacara éksténsif pikeun nalungtik spésiés véktor pikeun meunangkeun insight kana struktur populasi, seleksi lumangsung, jeung aliran gén18,19. Pikeun An. Stephensi, ngulik struktur populasi sareng struktur génom tiasa ngabantosan jalan invasi sareng évolusi adaptif naon waé anu lumangsung ti saprak mecenghulna. Salian aliran gén, seleksi penting pisan sabab bisa nangtukeun alél pakait sareng résistansi inséktisida jeung ngajelaskeun kumaha alél ieu nyebarkeun ngaliwatan populasi20.
Nepi ka ayeuna, uji spidol résistansi inséktisida sareng genetika populasi dina spésiés invasif Anopheles stephensi parantos dugi ka sababaraha gen calon. Mecenghulna spésiés 'di Afrika teu pinuh dipikaharti, tapi hiji hipotésis nya éta diwanohkeun ku manusa atawa ingon-ingon. Téori séjén kaasup migrasi jarak jauh ku angin. Isolat Ethiopian dipaké dina ulikan ieu dikumpulkeun di Awash Sebat Kilo, hiji kota ayana 200 km wétaneun Addis Ababa sarta dina koridor angkutan utama ti Addis Ababa ka Djibouti. Awash Sebat Kilo mangrupikeun daérah anu panyebaran malaria anu luhur sareng gaduh populasi Anopheles stephensi anu ageung, anu dilaporkeun tahan ka inséktisida, janten tempat anu penting pikeun diajar genetik populasi Anopheles stephensi8.
The mutasi résistansi inséktisida kdr L1014F dideteksi dina frékuénsi low dina populasi Ethiopian sarta teu kauninga dina sampel widang India. Mutasi kdr ieu masihan résistansi ka pyrethroids sareng DDT sareng sateuacana dideteksi dina An. Populasi stephensi dikumpulkeun di India di 2016 sareng Afghanistan di 2018.31,32 Sanaos bukti résistansi pyrethroid nyebar di dua kota, mutasi kdr L1014F henteu dideteksi dina populasi Mangalore sareng Bangalore anu dianalisis di dieu. Proporsi low isolat Ethiopian mawa SNP ieu heterozygous nunjukkeun yén mutasi timbul anyar dina populasi ieu. Ieu dirojong ku ulikan saméméhna di Awash nu kapanggih euweuh bukti mutasi kdr dina sampel dikumpulkeun dina taun saméméh maranéhanana dianalisis here.18 Urang saméméhna geus ngaidentipikasi ieu kdr L1014F mutasi dina frékuénsi low dina susunan sampel ti wewengkon sarua / taun ngagunakeun pendekatan deteksi amplicon. modifikasi tanggung jawab pikeun phenotype ieu observasi.
Watesan tina ieu panalungtikan nyaéta kurangna data fenotipik ngeunaan réspon inséktisida. Panaliti satuluyna ngagabungkeun urutan génom sakabeh (WGS) atawa urutan amplicon sasaran dina kombinasi jeung bioassays kerentanan diperlukeun pikeun nalungtik dampak mutasi ieu dina respon inséktisida. SNPs missense novél ieu anu tiasa dikaitkeun sareng résistansi kedah ditargetkeun pikeun tés molekular-throughput tinggi pikeun ngadukung ngawaskeun sareng ngagampangkeun padamelan fungsional pikeun ngartos sareng mastikeun mékanisme poténsial anu aya hubunganana sareng fénotip résistansi.
Kasimpulanana, ulikan ieu masihan pamahaman anu langkung jero ngeunaan genetika populasi reungit Anopheles di sakuliah buana. Aplikasi analisis sekuensing génom (WGS) kanggo sampel sampel anu langkung ageung di daérah géografis anu béda-béda bakal janten konci pikeun ngartos aliran gen sareng ngaidentipikasi spidol résistansi inséktisida. Pangaweruh ieu bakal ngamungkinkeun otoritas kaséhatan masarakat ngadamel pilihan anu terang dina panjagaan vektor sareng panggunaan inséktisida.
Kami nganggo dua pendekatan pikeun ngadeteksi variasi nomer salinan dina set data ieu. Mimiti, kami nganggo pendekatan dumasar-liputan anu museurkeun kana klaster gén CYP anu diidentifikasi dina génom (Tabel Tambahan S5). Cakupan sampel rata-rata di sakuliah lokasi koleksi jeung dibagi kana opat grup: Étiopia, widang India, koloni India, jeung koloni Pakistani. Sinyalna pikeun unggal grup dinormalisasi nganggo kernel smoothing teras diplot dumasar kana jerona sinyalna génom median pikeun grup éta.


waktos pos: Jun-23-2025