Ti saprak kapanggihna di Djibouti dina taun 2012, reungit Anopheles stephensi Asia parantos nyebar ka sakumna Tanduk Afrika. Vektor invasif ieu terus nyebar ka sakuliah buana, janten ancaman serius pikeun program pangendalian malaria. Métode pangendalian vektor, kalebet kelambu anu dirawat inséktisida sareng nyemprot sésa-sésa di jero ruangan, parantos ngirangan beban malaria sacara signifikan. Nanging, ningkatna prévalénsi reungit anu tahan inséktisida, kalebet populasi Anopheles stephensi, ngahalangan upaya éliminasi malaria anu terus-terusan. Ngartos struktur populasi, aliran gén antara populasi, sareng distribusi mutasi résistansi inséktisida penting pisan pikeun nungtun strategi pangendalian malaria anu efektif.
Ningkatkeun pamahaman urang ngeunaan kumaha An. stephensi janten mapan di HOA penting pisan pikeun ngaduga poténsi panyebaranana ka daérah énggal. Génétika populasi parantos dianggo sacara éksténsif pikeun nalungtik spésiés véktor pikeun kéngingkeun wawasan ngeunaan struktur populasi, seleksi anu lumangsung, sareng aliran gén18,19. Pikeun An. stephensi, nalungtik struktur populasi sareng struktur génom tiasa ngabantosan ngajelaskeun rute invasi na sareng évolusi adaptif naon waé anu tiasa kajantenan saprak munculna. Salian ti aliran gén, seleksi penting pisan sabab tiasa ngaidentipikasi alel anu aya hubunganana sareng résistansi inséktisida sareng ngajelaskeun kumaha alel ieu nyebar ka sakumna populasi20.
Nepi ka ayeuna, uji coba pananda résistansi inséktisida sareng genetika populasi dina spésiés invasif Anopheles stephensi diwatesan kana sababaraha calon gén. Munculna spésiés ieu di Afrika teu acan kahartos sapinuhna, tapi hiji hipotesis nyaéta yén éta diwanohkeun ku manusa atanapi ingon-ingon. Téori sanésna kalebet migrasi jarak jauh ku angin. Isolat Étiopia anu dianggo dina panilitian ieu dikumpulkeun di Awash Sebat Kilo, hiji kota anu aya 200 km wétaneun Addis Ababa sareng di koridor transportasi utama ti Addis Ababa ka Djibouti. Awash Sebat Kilo mangrupikeun daérah anu transmisi malariana luhur sareng gaduh populasi Anopheles stephensi anu ageung, anu dilaporkeun tahan kana inséktisida, jantenkeun éta tempat anu penting pikeun nalungtik genetika populasi Anopheles stephensi8.
Mutasi résistansi inséktisida kdr L1014F dideteksi dina frékuénsi anu handap dina populasi Étiopia sareng henteu dideteksi dina sampel lapangan India. Mutasi kdr ieu masihan résistansi kana piretroid sareng DDT sareng sateuacanna dideteksi dina populasi An. stephensi anu dikumpulkeun di India dina taun 2016 sareng Afghanistan dina taun 2018.31,32 Sanaos aya bukti résistansi piretroid anu nyebar di dua kota éta, mutasi kdr L1014F henteu dideteksi dina populasi Mangalore sareng Bangalore anu dianalisis di dieu. Proporsi isolat Étiopia anu handap anu mawa SNP ieu anu hétérozigot nunjukkeun yén mutasi ieu nembe muncul dina populasi ieu. Ieu dirojong ku panilitian sateuacana di Awash anu henteu mendakan bukti mutasi kdr dina sampel anu dikumpulkeun dina sataun sateuacan anu dianalisis di dieu.18 Kami sateuacanna ngaidentipikasi mutasi kdr L1014F ieu dina frékuénsi anu handap dina sakumpulan sampel ti daérah/taun anu sami nganggo pendekatan deteksi amplikon.28 Kusabab résistansi fenotipik di situs sampling, frékuénsi alel anu handap tina pananda résistansi ieu nunjukkeun yén mékanisme sanés tibatan modifikasi situs target tanggung jawab pikeun fenotipe anu dititénan ieu.
Watesan tina ieu panilitian nyaéta kurangna data fenotipik ngeunaan réspon inséktisida. Panilitian salajengna anu ngagabungkeun sekuensing génom lengkep (WGS) atanapi sekuensing amplikon anu ditargetkeun digabungkeun sareng bioassay suseptibilitas diperyogikeun pikeun nalungtik dampak mutasi ieu kana réspon inséktisida. SNP missense anyar ieu anu tiasa aya hubunganana sareng résistansi kedah ditargetkeun pikeun uji molekuler throughput tinggi pikeun ngadukung pangawasan sareng ngagampangkeun padamelan fungsional pikeun ngartos sareng ngavalidasi mékanisme poténsial anu aya hubunganana sareng fenotipe résistansi.
Singkatna, panilitian ieu nyayogikeun pamahaman anu langkung jero ngeunaan genetika populasi reungit Anopheles di sakumna buana. Aplikasi analisis sekuensing genom lengkep (WGS) kana kohort sampel anu langkung ageung di daérah géografis anu béda bakal janten konci pikeun ngartos aliran gén sareng ngaidentipikasi pananda résistansi inséktisida. Pangaweruh ieu bakal ngamungkinkeun otoritas kaséhatan masarakat pikeun ngadamel pilihan anu tepat dina panjagaan vektor sareng panggunaan inséktisida.
Kami nganggo dua pendekatan pikeun ngadeteksi variasi jumlah salinan dina sét data ieu. Mimitina, kami nganggo pendekatan dumasar cakupan anu museur kana klaster gén CYP anu diidentipikasi dina génom (Tabel Tambahan S5). Cakupan sampel dirata-ratakeun di sakuliah lokasi pangumpulan sareng dibagi kana opat kelompok: Étiopia, ladang India, koloni India, sareng koloni Pakistan. Cakupan pikeun unggal kelompok dinormalisasi nganggo kernel smoothing teras diplot numutkeun jerona cakupan génom median pikeun kelompok éta.
Waktos posting: 23 Juni 2025



